如果女方失踪多年，男方想要离婚，可以向法院提起离婚诉讼，并请求法院宣告女方失踪，在女方被宣告失踪的情况下，法院会根据相关法律规定，对夫妻财产分割、子女抚养等问题进行判决，并最终判决离婚，男方需要提供相关证据证明女方已经失踪多年，例如警方立案证明、亲属证言等，如果男方无法证明女方已经失踪多年，则离婚诉讼可能会受到阻碍，在离婚过程中，男方需要寻求法律援助，通过法律途径解决问题。